近日,中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜計劃(CGGA)數(shù)據(jù)庫發(fā)布了2000例中國腦膠質(zhì)瘤樣本的功能基因組學(xué)數(shù)據(jù),并向全世界研究者免費(fèi)開放。
據(jù)了解,經(jīng)過15年的臨床標(biāo)本和組學(xué)數(shù)據(jù)積累,該數(shù)據(jù)庫日臻完善。據(jù)不完全統(tǒng)計,已有美國、歐洲多家知名研究機(jī)構(gòu)的近200篇SCI論文引用該數(shù)據(jù)庫。
“腦膠質(zhì)瘤是成人最常見的顱內(nèi)原發(fā)惡性腫瘤?!盋GGA發(fā)起人和創(chuàng)建者、北京市神經(jīng)外科研究所副所長、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院神經(jīng)外科副主任江濤介紹,此次公布的2000例中國腦膠質(zhì)瘤樣本的功能基因組學(xué)數(shù)據(jù),涉及不同組織病理分類、不同惡性度分級等。數(shù)據(jù)庫中包含了詳盡的臨床數(shù)據(jù),包括患者性別、年齡、放療和化療情況、完整隨訪數(shù)據(jù)等。針對不同組學(xué)數(shù)據(jù)特點(diǎn),研究團(tuán)隊(duì)還開發(fā)了不同的在線分析工具,包括腦膠質(zhì)瘤突變圖譜繪制、基因表達(dá)及其DNA甲基化的分布模式展示、相關(guān)性分析以及生存分析結(jié)果可視化等。該數(shù)據(jù)庫的建立,有助于描繪中國人群腦膠質(zhì)瘤的基因組及分子遺傳學(xué)特征,探尋腦膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展過程中的重要分子機(jī)制,為腦膠質(zhì)瘤的分子分型和藥物靶點(diǎn)研發(fā)提供指導(dǎo),并為腦膠質(zhì)瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)全鏈條的發(fā)展奠定基礎(chǔ)。江濤表示,希望通過基因組學(xué)技術(shù)分析,全面繪制中國人群的腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜,讓國內(nèi)外更多從事腦膠質(zhì)瘤的研究者可以對數(shù)據(jù)庫進(jìn)行挖掘利用。
自2004年起,江濤開始致力于中國腦膠質(zhì)瘤生物樣本庫的建立及臨床隨訪數(shù)據(jù)的收集。在我國神經(jīng)外科創(chuàng)始人王忠誠院士的指導(dǎo)下,2012年,江濤團(tuán)隊(duì)啟動CGGA。依托于國家神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、北京市神經(jīng)外科研究所以及首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院,目前,CGGA數(shù)據(jù)庫已經(jīng)成為亞洲乃至全世界最大規(guī)模的腦膠質(zhì)瘤醫(yī)學(xué)信息工程。江濤強(qiáng)調(diào),不斷建設(shè)和完善的CGGA數(shù)據(jù)庫,將對促進(jìn)我國腦膠質(zhì)瘤領(lǐng)域基礎(chǔ)和臨床研究水平的發(fā)展并提高我國癌癥研究的國際影響力,最終推動腦膠質(zhì)瘤新型診療模式的發(fā)展,讓更多腦膠質(zhì)瘤患者獲益起到積極作用。(記者田雅婷)