近日,由中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所與中國科學(xué)院北京基因組研究所合作開發(fā)的犬科動(dòng)物數(shù)據(jù)庫“iDog”正式上線。該研究成果在國際著名學(xué)術(shù)期刊上在線發(fā)表。
家犬是人類最好的朋友之一,同時(shí)也是許多人類遺傳病的基礎(chǔ)研究模型。
“iDog”是第一個(gè)家犬與野生犬科動(dòng)物整合性資源數(shù)據(jù)庫,它不僅提供了豐富的組學(xué)數(shù)據(jù)、基因組拼接數(shù)據(jù)、基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)和犬類疾病及相關(guān)表型信息,同時(shí)還整合了序列比對(duì)工具用于線上數(shù)據(jù)分析,以及基因組瀏覽器用于數(shù)據(jù)可視化。
據(jù)了解,“iDog”具有良好的可拓展性和持續(xù)性等特點(diǎn),其包含的主要模塊有基于127個(gè)家犬樣本基因組重測序數(shù)據(jù)產(chǎn)生的變異信息數(shù)據(jù)庫,含有32220個(gè)基因的犬科動(dòng)物基因數(shù)據(jù)庫、犬科動(dòng)物相關(guān)疾病的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫、人—狗疾病同源信息數(shù)據(jù)庫、犬科動(dòng)物基因組拼接數(shù)據(jù)庫等。這一數(shù)據(jù)庫的建立不僅有利于全球范圍內(nèi)犬科動(dòng)物的研究,同時(shí)還為愛狗人士了解家犬提供相關(guān)信息服務(wù)。(云南日?qǐng)?bào) 記者季征)